異なる学問背景・研究分野の様々な学生が集う総合生存学館では、学生一人ひとりのニーズに応じて、学館内の教員のみならず他部局の研究指導協力教員も含めた複数指導教員体制をとります。学生それぞれ独自の履修カリキュラムを設計することが可能です。

5年間にわたるカリキュラムは、大きく分けて、専門性を構築しながら幅広い分野にまたがる授業を履修して視野を広げる前半（1～2年次）と、自らの専門性をベースとしながら、より「総合生存学」的な社会実装へ取り組む後半（3～5年次）の2段階で構成されています。

総合生存学館内には、様々なグローバル課題ごとに文理を横断して複数の分野の教員や学生が参加する複合型研究会があり、多くの学生が複数の複合型研究会に所属して、異分野の学生、教員との共同研究に取り組んでいます。

学位研究を進める上で、実験や観測など専門的な施設・設備を必要とする場合には、学館外の研究指導協力教員の協力を得て、その研究室が保有する機器等を利用して研究を進めることも可能です。

修了要件を満たせば、「博士（総合学術）」の学位が授与されます。また、2年以上在学して研究指導を受け、一定の条件を満たせば、「修士（総合学術）」の学位が授与されます。